Маршрут выставки «Великие учителя» строится тематически, и ведет посетителя через разделы «Радость жизни», «Город», «Родной край», «Люди и судьбы» и «Мир искусства». Эти разделы служат своеобразными мостиками не только к творчеству учеников каждого из представленных художников, но и к художественной истории региона в целом, частью которой явилось строительство и открытие филиала Третьяковской галереи в Калининграде. Идею выставки поддерживает ее архитектура, вступающая в диалог с архитектурой самих залов. Здесь одновременно делаются отсылки к массовому строительству новых жилых кварталов в регионе в 1960–1970-е годы и к современной архитектуре, которым одинаково свойственны лаконизм, использование простых геометрических форм и сочетание брутальных бетонных и теплых, «живых» деревянных поверхностей.
Открывают экспозицию произведения двух выдающихся «певцов советской жизни» Александра Самохвалова и Юрия Пименова. Героями полотен Самохвалова становились его современники и особенно современницы — он запечатлевает спортивные парады, полнотелых и здоровых спортсменок и метростроевок, кондукторш и работниц. Тогда же в 1930-е годы к теме города и современной жизни обращается Пименов и придает ей особое звучание в эпоху оттепели, создав работы, ставшие подлинным художественным отражением своего времени. В этом же зале представлены скульптурные работы Матвея Манизера и его супруги Елены Янсон-Манизер. Раздел экспозиции «Город» посвящен строительству новых сооружений и созданию памятников известным историческим персонам.
В последнем зале один за другим разворачиваются три тематических блока. В разделе «Родной край» вступают в диалог произведения Константина Коровина, Фёдора Богородского и Матвея Манизера. Лиричные пейзажи дополнены скульптурными портретами великого русского поэта А.С. Пушкина, воспевшего в своих стихах красоту русских просторов, и известного педагога, основоположника научной педагогики в России К.Д. Ушинского. Раздел «Родной край» логично продолжает следующий — «Люди и судьбы», знакомящий с незаурядными представителями научного мира и героями из народа, такими как Зоя Космодемьянская.
Финальный раздел выставки «Мир искусства» решен как импровизированная мастерская художника, погружающая в атмосферу творческого вдохновения. Здесь зрителя встречает целый ряд портретов — от камерных и интимных образов до узнаваемых изображений личностей мирового масштаба, отражающих мир созданных ими творений.
Завершающим аккордом экспозиции становятся произведения, посвященные непосредственно образу художника-учителя, которые возвращают к главной теме выставки. Портретный бюст Матвея Манизера, созданный Еленой Янсон-Манизер, и масштабное полотно Гелия Коржева «Рабочая студия (Гомер)» звучат как ода Мастеру и Мастерству, которое он передает, обучая азам профессии и вдохновляя собственным примером на развитие, поиск и воплощение мечты стать творцом в самом высоком смысле этого слова.